Институтот за патолошка анатомија ги проучува морфолошките промени кај болестите на различни органи и системи. Преку хистопатолошки и цитолошки анализи, се дијагностицираат малигни и бенигни заболувања, со што институтот има значајна улога во современата медицинска практика и третманот на пациентите.